nulya, добрый день
Цитата: В прошлом году мы выставили сф на аванс, включили ее в декларацию НДС и уплатили с нее налог. В этом году в прошлом квартале выписали сф на остаток и так же уплатили НДС.
немного не понятно, что за остаток.
Должно быть так:
Получили аванс - выписали с/ф на аванс. ( ст 167 НК РФ, ст 168 НК РФ). Произвели отгрузку - выписали с/ф на поставку, одновременно сумму отразили в книге покупок зачет сумм с авансовой фактуре по этой отгрузке. Если отгрузка не покрыла всю сумму аванса, то зачет делается по мере отгрузок.
Цитата: Но наш контрагент в прошлом году не проводил сф на аванс и не возмещал НДС
Если у поставщика выставить авансовый фактуру в момент получения денег обязанность, то у покупателя отражать этот авансовый фактуру в книге покупок право. (ст. 171 НК РФ )
Цитата: в этом году сделал сф(сам как то) на всю сумму
А вот что он сделал как-то сам это не ваша головная боль.
Цитата: с налоговой пришло требование о пояснении, подскажите пожалуйста как исправить ситуацию?
Вы пишите ответ на требование в котором прописываете ситуацию:
Согласно п 3 ст 168 НК РФ в течение 5 календарных дней со дня получения аванса организация обязана выставить авансовый счет-фактура. Такого числа от контрагента такого-то был получен авансовый платеж на сумму такую -то п/п № от числа, нами была выставлена с/ф на аванс № ... от такого числа. Данные операции своевременно отражены в книгах покупок и продаж, а так же в декларации по НДС.
и приложите копии п/п от контрагента, копию с/ф на аванс, копию с/ф на отгрузку, выписки из книг покупок и продаж по данному контрагенту.